بلغت الانتهاكات الإسرائيلية بحق المدنيين حدًا خطيرًا مع لجوء جنود الاحتلال إلى انتهاج ممارسات غير إنسانية تتنافى مع بنود اتفاقية جنيف للأسرى والمعتقلين.
منذ العدوان الإسرائيلي على قطاع غزة ندّد البابا في كل مناسبة ظهر فيها أو رسالة وجهها لرعيته، بالعدوان، وفي ديسمبر 2024 اتهمته تل أبيب بما وصفته "ازدواجية المعايير".